C целью совершенствования и координирования учебно-методической работы в университете, оперативного управления и контроля деятельности методических комиссий факультетов при университете функционирует Методический Совет под председательством первого заместителя председателя Правления Абдырова А. М.
В его составе работают 4 секции:
1. Секция учебных планов и программ — обсуждает и утверждает Модульные образовательные программы, Модульные учебные планы и Рабочие учебные планы специальностей бакалавриата по всем формам обучения, рассматривает каталоги элективных дисциплин по специальностям, контролирует работу комитетов по учебным планам и программам на факультетах.
2. Секция совершенствования форм и методов обучения, контроля знаний,
умений и навыков студентов — организовывает и проводит круглые столы и семинары для преподавателей по современным трендам в сфере высшего образования.
3. Секция менеджмента качества образования — проводит семинары по проблемам обеспечения качества учебного процесса, готовит материалы для участия в международных академических рейтингах вузов.
4. Секция рецензирования и планирования выпуска учебно-методической литературы – курирует вопросы издания учебно-методической литературы.
В связи с реализацией Программы развития полиязычного обучения университета на 2012-2016 гг. ректорат, председатели методических комиссий факультетов, деканаты, заведующие кафедрами и профессорско-преподавательский состав стремятся максимально обеспечить полиязычное обучение необходимой учебно-методической литературой. Особое внимание уделено разработке УМКД, изданию учебников и учебных пособий на английском языке, словарей на трех языках. В план издания учебно-методической литературы на 2015-2016 учебный год включены 435 наименований УМЛ, в том числе на государственном языке — 189 и на английском языке — 40. За последние три года через библиотеку университета приобретено 1640 экземпляров учебно-методической литературы на английском языке, также имеются 3 электронные базы данных на английском языке.